SESAEQROO es un organismo público descentralizado con autonomía técnica y de gestión. Su misión es brindar asistencia técnica y los insumos necesarios al Comité Coordinador del Sistema Anticorrupción del Estado, conforme a las atribuciones establecidas en la Constitución Política del Estado y la Ley del Sistema Anticorrupción. Su visión es consolidar el Sistema Anticorrupción mediante el diseño, promoción, implementación y seguimiento de políticas públicas que prevengan, detecten y sancionen actos de corrupción, así como la fiscalización de recursos públicos. Las funciones de la Secretaría incluyen medir y evaluar los avances en la lucha contra la corrupción, desarrollar estudios sobre esta problemática y proporcionar apoyo político, metodológico y coordinado a los integrantes del Sistema Estatal Anticorrupción.